Қазақстан Республикасындағы ЕО Өкілдігі 1994 жылы ашылды. Алғаш кеңсе Алматы қаласында орналасып, Орталық Азиядағы тұңғыш ЕО Өкілдігі болды. 

2007 жылы Қазақстандағы ЕО Өкілдігінің бас кеңсесі мемлекеттің жаңа ордасы – Астана қаласына көшірілді. Алматыдағы кеңсе 2010 жылғы 1 қарашада жабылып, оның барлық қатысты қызмет орындары Астанаға көшірілді. 

Өкілдіктің қызметі: 

• Қазақстандағы ЕО мүдделерін қорғау.
• ЕО елдерінің елшіліктерін біріктіру.
• Саяси ынтымақтастық, экономика, сауда және сыртқы көмек сияқты салалардағы қарым-қатынастарды әсіресе ЕО-Қазақстан Кеңейтілген әріптестік және ынтымақтастық келісімін қолдану арқылы дамыту. 
• ЕО саясаттарын барлық салаларда әсіресе ЕО-Орталық Азия: Жаңа серіктестік стратегиясы арқылы жүзеге асыру.
• ЕО құндылықтары мен мүдделерін алға жылжыту және қорғау.
• ЕО туралы хабардарлықты арттыру.

Кеңсенің құрылымы: 

• Өкілдік Басшысы. 
• Саясат, баспасөз және ақпарат бөлімі. 
• Сауда мәселелері бөлімі.  
• Ынтымақтастық бөлімі. 
• Қаржы және келісімшарттар бөлімі.
• Әкімшілік бөлімі.